近日,《中华疾病预防控制中心周刊》(ChinaCDCWeekly)在最新一期发表的一篇文章中表示,2020年12月14日,我国海关实验室监测了一名23岁的新冠感染女性,他们是从国外乘飞机返回的,并通过了测试发现该病例感染了新的冠状病毒株的新变种。值得一提的是,帮助发现我国新的冠状病毒新菌株的第一个海外变体的测序平台是MGISEQ-200,这是由MGI独立开发的紧凑,灵活且功能强大的高通量测序仪。
中国疾病预防控制中心周刊,根据许多方面披露的最新研究数据,这种在国外传播的新病毒株的传播能力预计将比普通病毒株高至少50%。尽管目前尚无证据表明这种新病毒株更具致死性或可导致更严重的疾病,但仍被认为对中国预防和控制新的冠状病毒构成了巨大的潜在威胁。
据了解,中国疾病预防控制中心已经对所有病毒株进行了系统的监测,并且在检测到第一个VOC株后已有报道,并将在中国官方杂志《中国疾病预防控制中心周刊》(China CDC Weekly)上向全球发布。 CDC。
据报道,疾病预防控制中心使用多重PCR来建立患者核酸样品的文库,并使用MGI的高通量测序平台MGISEQ-200对病毒核酸文库进行深度测序。通过分析MGISEQ-200测序数据的生物学信息,研究人员发现该菌株与11月份监测的菌株不同,显示32个核苷酸变异。
通过进一步比较,发现该患者感染了该病毒。该毒株的基因序列包含新病毒株VUI202012 / 01中的所有28个突变,该突变株于10月下旬开始在海外传播,包括3个氨基酸缺失和刺突蛋白中的7个氨基酸突变。
根据MGISEQ-200测序数据和流行病学调查结果,国家疾病预防控制中心将此输入的病例定义为在中国监测的首例英国变异VUI202012 / 01病毒株,并加强了与患者密切接触的调查和调查。消除相关场所。
基于MGISEQ-200测序数据组装的COVID-19全基因组序列的系统树。外来突变株的VUI-202012 / 01变体以深绿色突出显示,在上海首次检测到的VUI-202012 / 01变体用红点表示。
新的冠状病毒的连续突变是当前世界面临的主要挑战。由MGI独立开发的高通量测序仪,具有高深度和高精度,可以对病原体的整个基因组序列进行深度测序,并找到病毒的突变位置。
单击以识别病毒的身份并找到病毒的来源。 MGISEQ-200是一款紧凑,灵活且功能强大的高通量测序仪。
它可以完美地适应病原体检测,组装和可追溯性应用,以满足精确疾病预防和控制的需求。此外,测序平台现已启动新配置,以支持更多的极端文库测序,从而大大提高了测序速度。
目前,MGISEQ-200已在世界许多国家的海关实验室和疾病预防和控制中心驻扎,为这一流行病的前线提供了重要的支持。